Laporan tes genetik risiko kanker dapat berkisar dari laboratorium ke laboratorium

Menurut penelitian baru-baru ini, pengujian mutasi gen yang terkait dengan risiko kanker dapat menentukan cara pasien dirawat, namun menentukan apakah suatu mutasi berbahaya atau jinak mungkin berbeda dari satu laboratorium ke laboratorium lainnya.

Dalam menganalisis hasil laboratorium yang berbeda, para peneliti menemukan bahwa identifikasi mutasi sebagai ‘patogen’, ‘tidak pasti’ atau ‘jinak’ berbeda dalam 26 persen kasus.

Terdapat pedoman untuk mengklasifikasikan varian gen, tetapi interpretasi pedoman tersebut dapat bervariasi menurut laboratorium atau pemasok, tulis para penulis dalam Journal of Clinical Oncology.

“Kita sekarang menghadapi era baru ketika pengujian genetik secara teknis dapat dilakukan dengan lebih mudah, namun masih ada tantangan yang tersisa dalam interpretasi data,” kata penulis utama, Dr. Judith Balmana dari rumah sakit Vall d’Hebron dan Universitat Autonoma de Barcelona di Spanyol. “Kami perlu mengumpulkan data yang cukup untuk menggunakannya secara tepat di klinik.”

“Saat kami menguji lebih banyak gen yang tidak kami gunakan untuk mengujinya, semakin banyak ketidakpastian,” kata penulis senior Dr. Susan M. Domchek dari University of Pennsylvania di Philadelphia menambahkan.

Para peneliti menggunakan data klinis, riwayat keluarga, dan hasil tes genetik dari 1.191 orang yang sebagian besar terdiagnosis kanker payudara. Pengujian risiko setelah seseorang didiagnosis menderita kanker terkadang dapat membantu dokter menentukan seberapa agresif pengobatan yang seharusnya dilakukan atau seberapa besar kemungkinan kanker akan kambuh lagi.

Analisis tersebut mengabaikan tes untuk apa yang disebut mutasi BRCA, yang sudah terbukti memiliki risiko kanker payudara, dan berfokus pada mutasi lain yang terkait dengan payudara, prostat, ovarium, dan lokasi lainnya.

Dalam kelompok ini, 518 orang menafsirkan hasil mereka melalui lebih dari satu laboratorium, termasuk setidaknya satu laporan dari Clinvar, arsip varian gen yang dapat diakses secara gratis di mana laboratorium juga dapat menyerahkan bukti yang menjadi dasar interpretasi mereka.

603 varian gen yang disajikan milik peserta ini adalah sebagai patogen, mungkin diklasifikasikan sebagai patogen, suatu ‘varian yang maknanya tidak pasti’, mungkin jinak atau jinak. Lebih dari sepertiganya diklasifikasikan sebagai ketidakpastian dan hampir sepertiganya tergolong patogen, yang berarti dikaitkan dengan peningkatan risiko kanker.

“Sejarah keluarga selalu penting untuk dimasukkan ke dalam konteksnya,” kata Domchek. “Genetika adalah salah satu bagian dari teka-teki.”

Seperempat dari hasil klinis panel kanker yang tersedia secara komersial bertentangan dengan Clinvar.

Sekitar 11 persen individu memiliki interpretasi yang bertentangan antara patogen, mungkin patogen, dan ‘tidak pasti’, yang merupakan hasil yang mungkin mengubah manajemen medis, kata tim peneliti.

“Laboratorium memiliki perbedaan dalam prosedur interpretasi hasil,” kata Dr. Jordan Lerner-Ellis, kepala diagnostik molekuler tingkat lanjut di Rumah Sakit Mount Sinai di Toronto, yang tidak terlibat dalam penelitian ini.

Genetika masih merupakan ilmu yang relatif baru dan para peneliti masih mengumpulkan informasi tentang arti berbagai varian gen, katanya kepada Reuters Health.

“Meskipun genom manusia telah berhasil dibuat pada tahun 2001, masih banyak hal yang belum kita ketahui,” katanya.

“Bahkan jika jenis varian tersebut dapat menyebabkan suatu kelainan, hal tersebut tidak selalu cukup untuk memberi tahu kita seberapa besar risiko seseorang tertular penyakit tersebut,” kata Lerner-Ellis. “Orang yang memiliki varian patogen yang terdefinisi dengan baik tidak selalu tertular penyakit ini,” karena ada faktor lingkungan dan faktor genetik lainnya.

Di kota yang sama, satu laboratorium dapat menyebut no-varian sebagai “makna tidak pasti”, dan laboratorium lain dapat menyebutnya “patogen” jika mereka bekerja dengan data yang berbeda, katanya. “Upaya bagian data akan sangat penting bagi laboratorium untuk mencapai interpretasi konsensus.”

Masih belum sepenuhnya jelas keputusan penatalaksanaan atau pengobatan apa yang dapat diambil pasien berdasarkan hasil tes tersebut, tambahnya.

“Yang paling penting, jika Anda bekerja dengan konselor genetik, mereka harus menyadari masalah ini dan mempertimbangkan masalah ini,” kata Domchek. “Saya akan bertanya kepada presenter saya, apa hasil ini, apakah ada ambiguitas?”